La Basilica di S. Francesco è un mirabile esempio di monumento gotico francese ed è anche una delle prime chiese gotiche bolognesi. La facciata in laterizio presenta, nel sottotetto, delle bellissime e preziosissime bacinelle in maiolica colorata. La chiesa, consacrata nel 1254, ha due campanili: quello più piccolo è del 1260, mentre il più alto è datato 1397 e fu costruito dall'architetto Antonio di Vincenzo.
L'interno, a tre navate è reso ancora più bello dall'accostamento dei colori marrone e bianco, ma la cosa più notevole è la pala d'altare marmorea che raffigura la vita di S. Francesco d'Assisi.
Dalla chiesa si accede al bellissimo chiostro dei morti dove sono sepolti molti lettori dell'Università di Bologna, e sul retro che si affaccia sulla piazza Malpighi vi sono le tombe di tre glossatori, cioè Maestri di diritto romano, tra cui Accursio.